Volgens de overlevering werd de San Francesco kerk in Pisa gebouwd na een preek van de heilige Franciscus. Hij hield de preek in 1211 en maakte daarbij veel indruk op de mensen. Twee van zijn Pisaanse volgelingen, Agnello en Alberto, besloten tot de bouw van het eerste Franciscaner gebouw. De architectonische structuur van de kerk reflecteert de typische Franciscaner stijl: eenvoudige lijnen, slechte materialen en vaste afmetingen (18m bij 70m). Noemenswaardig is de klokkentoren die niet rust op de grond maar op de twee zijden van het schip. Een deel van de kerk werd in 1899 een museum en is vandaag de dag een school. De binnenste kloostergang wordt gebruikt door de parochianen. In de kerk zijn enkele 17de-eeuwse schilderijen te bewonderen.